MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis MC58 chromosome

Total Repeats: 48922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003112	ACC	2	6	74	79	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675949
2	NC_003112	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15675949
3	NC_003112	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	15675949
4	NC_003112	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675949
5	NC_003112	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675949
6	NC_003112	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15675949
7	NC_003112	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15675949
8	NC_003112	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	15675949
9	NC_003112	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675950
10	NC_003112	GC	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	15675950
11	NC_003112	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675950
12	NC_003112	TTTTGC	2	12	725	736	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15675950
13	NC_003112	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	15675950
14	NC_003112	AAAAT	2	10	823	832	80 %	20 %	0 %	0 %	15675950
15	NC_003112	T	7	7	834	840	0 %	100 %	0 %	0 %	15675950
16	NC_003112	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675951
17	NC_003112	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675951
18	NC_003112	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675951
19	NC_003112	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675951
20	NC_003112	GTTT	2	8	1189	1196	0 %	75 %	25 %	0 %	15675951
21	NC_003112	GTAGAA	2	12	1200	1211	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15675951
22	NC_003112	TCG	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675951
23	NC_003112	CGCAA	2	10	1306	1315	40 %	0 %	20 %	40 %	15675951
24	NC_003112	T	6	6	1389	1394	0 %	100 %	0 %	0 %	15675951
25	NC_003112	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	15675951
26	NC_003112	GAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675951
27	NC_003112	TCG	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675951
28	NC_003112	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	15675951
29	NC_003112	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675951
30	NC_003112	T	7	7	1586	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	15675951
31	NC_003112	ATC	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675951
32	NC_003112	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15675951
33	NC_003112	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675951
34	NC_003112	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675951
35	NC_003112	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675951
36	NC_003112	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675951
37	NC_003112	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675951
38	NC_003112	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675951
39	NC_003112	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675951
40	NC_003112	ACG	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675951
41	NC_003112	GACC	2	8	2117	2124	25 %	0 %	25 %	50 %	15675951
42	NC_003112	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675951
43	NC_003112	CGG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675951
44	NC_003112	ATG	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675951
45	NC_003112	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675951
46	NC_003112	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675951
47	NC_003112	CTGC	2	8	2389	2396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_003112	CGC	2	6	2462	2467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_003112	A	8	8	2495	2502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003112	A	6	6	2524	2529	100 %	0 %	0 %	0 %	15675952
51	NC_003112	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675952
52	NC_003112	T	7	7	2591	2597	0 %	100 %	0 %	0 %	15675952
53	NC_003112	TCC	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15675952
54	NC_003112	CCG	2	6	2672	2677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675952
55	NC_003112	CAC	2	6	2709	2714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675952
56	NC_003112	CGGA	2	8	2742	2749	25 %	0 %	50 %	25 %	15675952
57	NC_003112	TGT	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15675952
58	NC_003112	GC	3	6	2802	2807	0 %	0 %	50 %	50 %	15675952
59	NC_003112	CCG	2	6	2832	2837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675952
60	NC_003112	T	6	6	2865	2870	0 %	100 %	0 %	0 %	15675952
61	NC_003112	CGG	2	6	2978	2983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675952
62	NC_003112	CGG	2	6	3018	3023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675952
63	NC_003112	GCC	2	6	3198	3203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675953
64	NC_003112	GAT	2	6	3244	3249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675953
65	NC_003112	GCA	2	6	3262	3267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675953
66	NC_003112	ATC	2	6	3317	3322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675953
67	NC_003112	CAT	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675953
68	NC_003112	CG	3	6	3340	3345	0 %	0 %	50 %	50 %	15675953
69	NC_003112	TTG	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15675953
70	NC_003112	GCG	2	6	3397	3402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675953
71	NC_003112	GCA	2	6	3426	3431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675953
72	NC_003112	TTC	2	6	3440	3445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675953
73	NC_003112	GGC	2	6	3458	3463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675953
74	NC_003112	TGC	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675953
75	NC_003112	TTA	2	6	3540	3545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003112	GCC	2	6	3668	3673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675954
77	NC_003112	ACA	2	6	3723	3728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15675954
78	NC_003112	TGCC	2	8	3813	3820	0 %	25 %	25 %	50 %	15675954
79	NC_003112	A	6	6	3845	3850	100 %	0 %	0 %	0 %	15675954
80	NC_003112	CAAA	2	8	3910	3917	75 %	0 %	0 %	25 %	15675954
81	NC_003112	CGT	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675954
82	NC_003112	A	6	6	4068	4073	100 %	0 %	0 %	0 %	15675954
83	NC_003112	TTTTC	2	10	4154	4163	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_003112	GCC	2	6	4286	4291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_003112	CCT	2	6	4305	4310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_003112	CGG	2	6	4346	4351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675955
87	NC_003112	CAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15675955
88	NC_003112	CCA	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675955
89	NC_003112	CCG	2	6	4638	4643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675955
90	NC_003112	CGG	2	6	4727	4732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675955
91	NC_003112	AAC	3	9	4735	4743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15675955
92	NC_003112	CGT	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675955
93	NC_003112	CTG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675955
94	NC_003112	CGA	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675955
95	NC_003112	GAC	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675955
96	NC_003112	CAT	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675956
97	NC_003112	CG	3	6	4996	5001	0 %	0 %	50 %	50 %	15675956
98	NC_003112	AGC	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675956
99	NC_003112	ATG	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675956
100	NC_003112	CGC	2	6	5142	5147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675956
101	NC_003112	CCG	2	6	5172	5177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675956
102	NC_003112	CTG	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675956
103	NC_003112	GC	3	6	5213	5218	0 %	0 %	50 %	50 %	15675956
104	NC_003112	ACA	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15675956
105	NC_003112	AGA	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675956
106	NC_003112	GAA	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675956
107	NC_003112	CGCC	2	8	5364	5371	0 %	0 %	25 %	75 %	15675956
108	NC_003112	TTTC	2	8	5492	5499	0 %	75 %	0 %	25 %	15675956
109	NC_003112	CA	3	6	5532	5537	50 %	0 %	0 %	50 %	15675956
110	NC_003112	AGA	2	6	5569	5574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675956
111	NC_003112	GC	3	6	5598	5603	0 %	0 %	50 %	50 %	15675956
112	NC_003112	CGT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675956
113	NC_003112	CCG	2	6	5617	5622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675956
114	NC_003112	CCG	3	9	5661	5669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675956
115	NC_003112	GCT	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675956
116	NC_003112	CT	3	6	5696	5701	0 %	50 %	0 %	50 %	15675956
117	NC_003112	TTC	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675956
118	NC_003112	CCA	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675956
119	NC_003112	A	6	6	5867	5872	100 %	0 %	0 %	0 %	15675956
120	NC_003112	CAA	2	6	5950	5955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_003112	T	6	6	6049	6054	0 %	100 %	0 %	0 %	15675957
122	NC_003112	TCA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675957
123	NC_003112	AAGGC	2	10	6081	6090	40 %	0 %	40 %	20 %	15675957
124	NC_003112	CG	3	6	6097	6102	0 %	0 %	50 %	50 %	15675957
125	NC_003112	GCAC	2	8	6154	6161	25 %	0 %	25 %	50 %	15675957
126	NC_003112	GCC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675957
127	NC_003112	CGG	2	6	6186	6191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675957
128	NC_003112	AAT	2	6	6210	6215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15675957
129	NC_003112	CA	3	6	6219	6224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_003112	T	8	8	6261	6268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003112	CGC	2	6	6286	6291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
132	NC_003112	GGCA	2	8	6311	6318	25 %	0 %	50 %	25 %	15675958
133	NC_003112	CGC	3	9	6349	6357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
134	NC_003112	CGC	2	6	6404	6409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
135	NC_003112	CGC	3	9	6418	6426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
136	NC_003112	GCTTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	15675958
137	NC_003112	CGG	2	6	6538	6543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675958
138	NC_003112	ATC	2	6	6594	6599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675958
139	NC_003112	CAC	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675958
140	NC_003112	CGG	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675958
141	NC_003112	CAC	2	6	6662	6667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675958
142	NC_003112	CGG	2	6	6679	6684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675958
143	NC_003112	ACG	2	6	6699	6704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675958
144	NC_003112	TCGG	2	8	6708	6715	0 %	25 %	50 %	25 %	15675958
145	NC_003112	GCC	2	6	6738	6743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
146	NC_003112	T	7	7	6757	6763	0 %	100 %	0 %	0 %	15675958
147	NC_003112	TTC	2	6	6767	6772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675958
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150	NC_003112	TGC	2	6	6913	6918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675958
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152	NC_003112	CGCC	2	8	6982	6989	0 %	0 %	25 %	75 %	15675958
153	NC_003112	AAG	2	6	7096	7101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675958
154	NC_003112	TCT	2	6	7132	7137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675958
155	NC_003112	TTG	2	6	7143	7148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15675958
156	NC_003112	GCA	2	6	7162	7167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675958
157	NC_003112	GAC	2	6	7169	7174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675958
158	NC_003112	GTTT	2	8	7195	7202	0 %	75 %	25 %	0 %	15675958
159	NC_003112	TCGG	2	8	7299	7306	0 %	25 %	50 %	25 %	15675958
160	NC_003112	TCA	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675958
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162	NC_003112	GTC	2	6	7391	7396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675958
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166	NC_003112	GAC	2	6	7735	7740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675959
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171	NC_003112	GAC	2	6	8140	8145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675959
172	NC_003112	CGT	2	6	8287	8292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675959
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174	NC_003112	CAG	2	6	8317	8322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675959
175	NC_003112	GCC	2	6	8332	8337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675959
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180	NC_003112	TACCG	2	10	8590	8599	20 %	20 %	20 %	40 %	15675959
181	NC_003112	CG	4	8	8637	8644	0 %	0 %	50 %	50 %	15675959
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184	NC_003112	GGC	2	6	8881	8886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_003112	A	6	6	9156	9161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_003112	T	6	6	9183	9188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_003112	TGG	2	6	9197	9202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
188	NC_003112	GCT	2	6	9245	9250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_003112	GCGG	2	8	9321	9328	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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220	NC_003112	CAG	2	6	10608	10613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675961
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223	NC_003112	CCCGT	2	10	10691	10700	0 %	20 %	20 %	60 %	15675961
224	NC_003112	GGAC	2	8	10706	10713	25 %	0 %	50 %	25 %	15675961
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229	NC_003112	CTGCAT	2	12	10936	10947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15675962
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232	NC_003112	CCG	2	6	10998	11003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675962
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240	NC_003112	CGC	2	6	11340	11345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675962
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252	NC_003112	TCA	2	6	11700	11705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675962
253	NC_003112	T	7	7	11781	11787	0 %	100 %	0 %	0 %	15675962
254	NC_003112	TCA	2	6	11865	11870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675962
255	NC_003112	GCG	2	6	11874	11879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675962
256	NC_003112	CGC	3	9	11891	11899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675962
257	NC_003112	GGC	2	6	11920	11925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675962
258	NC_003112	CCGA	2	8	11936	11943	25 %	0 %	25 %	50 %	15675962
259	NC_003112	AGC	2	6	12077	12082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675962
260	NC_003112	CAT	2	6	12090	12095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675962
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262	NC_003112	GC	3	6	12272	12277	0 %	0 %	50 %	50 %	15675963
263	NC_003112	AGT	2	6	12281	12286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675963
264	NC_003112	GGCA	2	8	12309	12316	25 %	0 %	50 %	25 %	15675963
265	NC_003112	ACC	2	6	12400	12405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675963
266	NC_003112	GGCA	2	8	12418	12425	25 %	0 %	50 %	25 %	15675963
267	NC_003112	ATG	2	6	12526	12531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675963
268	NC_003112	CAG	2	6	12546	12551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675963
269	NC_003112	GCC	2	6	12684	12689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675963
270	NC_003112	ACG	2	6	12749	12754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675963
271	NC_003112	TCAGCG	2	12	12785	12796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15675963
272	NC_003112	CGC	2	6	12884	12889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675963
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275	NC_003112	GC	3	6	13180	13185	0 %	0 %	50 %	50 %	15675963
276	NC_003112	CCCG	2	8	13191	13198	0 %	0 %	25 %	75 %	15675963
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283	NC_003112	GCC	2	6	13320	13325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675963
284	NC_003112	CTT	2	6	13343	13348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675963
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291	NC_003112	T	6	6	13706	13711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_003112	TAAA	2	8	13758	13765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_003112	ATA	2	6	13779	13784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_003112	GAT	2	6	13789	13794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_003112	T	8	8	13827	13834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_003112	ATC	2	6	13844	13849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_003112	T	8	8	13858	13865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_003112	GAA	2	6	13920	13925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675964
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301	NC_003112	GTG	2	6	14126	14131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15675964
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303	NC_003112	TCAG	2	8	14168	14175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
304	NC_003112	ATG	2	6	14288	14293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_003112	A	6	6	14544	14549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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315	NC_003112	ATG	2	6	15173	15178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_003112	CCG	2	6	19847	19852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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404	NC_003112	T	6	6	20095	20100	0 %	100 %	0 %	0 %	77358701
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